復旦大學生物醫(yī)學人工智能實驗室

復旦大學生物醫(yī)學人工智能實驗室招聘生物信息學方向博士后和專任研究員

來源:科學人才網 ???? 發(fā)布時間:2024-8-28

一、生物醫(yī)學人工智能實驗室簡介

生物醫(yī)學人工智能實驗室聚焦于人工智能與生物醫(yī)學交叉研究,團隊成員來自計算機、數學、生物、物理等不同學科背景。實驗室基于多模態(tài)生物醫(yī)學大數據,面向健康風險預測、智能診療及干預、預后評估等發(fā)展和應用人工智能算法理論與技術。近年來,圍繞生物醫(yī)學大數據的特點,發(fā)展了一系列人工智能算法,已成功應用于腦-腸軸、腦發(fā)育和腦疾病等場景中,相關工作發(fā)表于Nature、Science、Cell、Cell Metabolism、IEEE TPAMI、Molecular Psychiatry、Nature Communications等期刊,曾獲吳文俊人工智能自然科學一等獎和教育部自然科學二等獎,承擔了國家杰出青年基金、國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金重點項目和面上項目、上海市重大科技專項子課題等項目。更多信息,可以訪問:http://mai.fudan.edu.cn

【研究方向】

1. 影像遺傳學

基于自產和國內外主流公共數據平臺的長短讀基因組、代謝組、蛋白組、行為量表數據,依托張江國際腦庫采集與收錄的海量磁共振腦影像數據:(1)開發(fā)算法識別影像-遺傳多模態(tài)腦疾病早期診療標記物、鑒定中國人群遺傳風險特征;(2)探究腦疾病的遺傳共性及其與衰老的關聯;(3)發(fā)展基于AI的醫(yī)學影像診斷模型、多模態(tài)新型治療干預方法等。

2. 單細胞與空間組學

致力于開發(fā)面向單細胞與空間組學數據的新型算法:(1)開發(fā)基于AI的單細胞空間組學數據整合挖掘算法,揭示跨尺度多維度分子信息;(2)構建腦組織的細胞時空圖譜,精準鑒定細胞亞型,重構細胞間相互作用,解析細胞亞群在腦發(fā)育和腦疾病中的作用和機制;(3)與合作者發(fā)展單細胞空間組學測序新技術,推動神經科學研究和精準醫(yī)療的發(fā)展。

3. 計算微生物組學

依托自產和公共數據平臺的海量微生物基因組、代謝組等數據:(1)研發(fā)長短讀段測序數據、多組學數據融合的宏基因組數據組裝分析流程與新型算法;(2)識別微生物物種、鑒定新基因、新蛋白;(3)研發(fā)病毒-細菌相互作用預測方法;(4)開展微生物多組學與宿主疾病/行為/基因組關聯分析及疾病分型等研究。

二、招聘崗位及職責

崗位一:博士后崗位

【研究方向】生物信息學方向博士后

【崗位職責】

1.利用生物信息學方法從事腦重大疾病的多組學數據分析。

2.獨立承擔或協助完成研究組組長交給的研究課題。

3.參與科研基金申請和協助研究組組長制定課題計劃及撰寫研究論文。

【應聘條件】

1.在海內外高水平大學即將獲得博士學位,或獲得博士學位一般不超過3年的優(yōu)秀博士/博士生,生物信息學、醫(yī)學影像學、計算機科學等專業(yè),科研成果突出。

2.品學兼優(yōu)、身心健康;年齡一般不超過 35 歲。

3.熟悉Unix/Linux操作系統,熟練使用R、Perl、Python?等語言中的一種。具有高通量多組學數據(Post-GWAS、genome sequencing 、eQTLs、RNA-Seq等)分析經驗。

4.具有較強的團隊合作精神,進站研究計劃需與合作導師的科研課題或者研究專長相關;具有較高科研熱情、較強英文讀寫與交流的能力。

崗位二:專任研究員崗位

【崗位職責】

協助團隊依托生物醫(yī)學大數據中心自產和國內外主流公共數據平臺的基因組學、磁共振影像組學、微生物組學和行為環(huán)境等數據,開展大數據驅動的腦疾病計算方法研究、影像-分子-環(huán)境多模態(tài)數據挖掘,開發(fā)人工智能方法識別腦疾病的風險因素和新型致病機制,發(fā)展多維度分子診斷等新型診療方法。

【應聘條件】

1. 擁護黨和國家的各項方針政策,遵守法律法規(guī),品行端正;身體健康,心理素質良好;愛崗敬業(yè),恪守學術規(guī)范和職業(yè)道德。

2. 具有生物信息學、醫(yī)學影像學、遺傳學、計算機科學、大數據等相關專業(yè)碩士及以上學位,具有一定的科研成果。

3. 年齡一般在35周歲以下。

4. 具有博士學位或中級專業(yè)技術職務任職資格。

5. 具有崗位所需的研究經歷、算法能力者,在國內外高水平期刊發(fā)表相關學術論文或獲得相關專利授權者優(yōu)先。

三、應聘條件

1. 擁護黨和國家的各項方針政策,遵守法律法規(guī),品行端正;身體健康,心理素質良好;愛崗敬業(yè),恪守學術規(guī)范和職業(yè)道德。

2. 具有生物信息學、醫(yī)學影像學、遺傳學、計算機科學、大數據等相關專業(yè)碩士及以上學位,具有一定的科研成果。

3. 年齡一般在35周歲以下。

4.?具有博士學位或中級專業(yè)技術職務任職資格。

5. 具有崗位所需的研究經歷、算法能力者,在國內外高水平期刊發(fā)表相關學術論文或獲得相關專利授權者優(yōu)先。

四、薪酬待遇

1.參照復旦大學相關標準提供具有國際競爭力的薪資待遇

2.支持申請各種基金項目:包括中國博士后基金、國家自然科學基金、上海揚帆計劃、上海市和復旦大學超博基金等

3.提供優(yōu)良的辦公環(huán)境及國際一流的研究平臺;協助申請教師/博士后公寓(已婚可申請兩室一廳);按照復旦大學相關政策,協助子女申請復旦大學附屬幼兒園和小學入學資格。

五、應聘材料及聯系方式

請申請者將個人簡歷、代表性論文發(fā)至:fuzib@fudan.edu.cn,郵件主題欄內請注明“應聘博士后或專任研究員”。

我們將致力于提供優(yōu)越的學術研究平臺、充足的自主探索空間和長期的職業(yè)發(fā)展支持,誠邀有志于學術研究的青年才俊加入!

六、生物醫(yī)學大數據平臺領銜PI介紹

趙興明教授
復旦大學類腦智能科學與技術研究院特聘教授,中山醫(yī)院雙聘教授,類腦智能科學與技術研究院副院長、計算神經科學與類腦智能教育部重點實驗室副主任、上海市生物信息學會理事長,張江國際腦庫執(zhí)行主任、國家自然基金杰出青年基金獲得者、上海市青年科技啟明星和上海市浦江人才計劃入選者、IEEE Senior Member、CCF 高級會員、中國人工智能學會人工生命與生物信息學專委會副主任、中國計算機學會生物信息學專委會常務委員、上海市計算機學會生物信息學專委會主任和ACM SIGBio China Vice Chair 等。
承擔了863、國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金重大研究計劃和重點項目在內的多項科研課題。在Nature、Cell Metabolism、Nature Communications、Genome Medicine、Nucleic Acids Research等國際著名期刊發(fā)表SCI論文100余篇,曾獲吳文俊人工智能自然科學獎一等獎和教育部自然科學二等獎。

課題組網站:http://mai.fudan.edu.cn

Peer Bork教授
復旦大學榮譽教授,歐洲分子生物學實驗室(EMBL) Senior Scientist,德國科學院院士。參與并主持了多項國際知名的基因組和宏基因組重大項目,包括人類基因組計劃(Human Genome Project)、老鼠基因組計劃(Mouse Genome Project)、酵母蛋白組計劃(Yeast Proteome Project)、人類腸道宏基因組計劃(MetaHit)、人類微生物組計劃(Human Microbe Project)和Tara海洋微生物計劃(Tara Ocean)等。在國際期刊上發(fā)表了近600篇研究論文,其中超過70篇發(fā)表在Cell、Nature和Science雜志