北京大學(xué)2024年誠聘遺傳流行病與統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)/AI方向博士后、科研助理

北京大學(xué)—遺傳流行病與統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)/AI方向誠聘博士后、科研助理

簡介

課題組致力于解析人類疾病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

課題組運(yùn)用大型隊(duì)列、遺傳流行病學(xué)、統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)、實(shí)驗(yàn)生物學(xué)和深度學(xué)習(xí)等多學(xué)科方法，整合單細(xì)胞多組學(xué)及功能基因組學(xué)，解析人類疾�。ò�括眼科疾病、神經(jīng)精神類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病等）的遺傳基礎(chǔ)和分子機(jī)制，揭示疾病發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)化的復(fù)雜過程，識(shí)別關(guān)鍵生物標(biāo)志物，發(fā)掘潛在藥物干預(yù)靶點(diǎn)，為疾病的早期篩查、風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)、治療及預(yù)后評(píng)估等多方面提供精準(zhǔn)化方案。

主要相關(guān)研究領(lǐng)域：

1）結(jié)合遺傳流行病學(xué)、統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)與進(jìn)化基因組學(xué)等方法，解析疾病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

2）采用單細(xì)胞多組學(xué)、功能基因組學(xué)等方法與前沿技術(shù)，探究疾病從遺傳到表觀遺傳、從基因到蛋白表達(dá)、從細(xì)胞到組織器官的多層次信息調(diào)控機(jī)制。

3）深度學(xué)習(xí)在基因組學(xué)與健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)中的方法及應(yīng)用。

4）主要研究疾病領(lǐng)域：眼科疾病（青光眼，視黃斑變性等）、神經(jīng)精神類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病等。

合作導(dǎo)師介紹 

韓西坤，先后于中山大學(xué)、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、澳大利亞昆士蘭大學(xué)/昆士蘭醫(yī)學(xué)研究所完成本科到博士階段的學(xué)習(xí)。2021年獲博士學(xué)位，博士研究方向?yàn)榻y(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)，師從Stuart MacGregor教授。博士畢業(yè)后，赴哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病系，遺傳流行病與統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)項(xiàng)目（導(dǎo)師：Liming Liang教授）；麻省理工學(xué)院計(jì)算機(jī)與人工智能實(shí)驗(yàn)室，Broad Institute of MIT and Harvard，計(jì)算生物學(xué)組（導(dǎo)師：Manolis Kellis教授）從事博士后研究。將于2024年加入北京大學(xué)，任研究員、博士生導(dǎo)師、新體制TTAP。

獲國家青年人才項(xiàng)目（海外）、美國人類遺傳學(xué)會(huì)研究獎(jiǎng)（Charles J. Epstein Trainee Research Award）、澳大利亞CSL Florey Next Generation Award、國家優(yōu)秀自費(fèi)留學(xué)生獎(jiǎng)學(xué)金等。

研究成果以第一/通訊作者發(fā)表于Nature Genetics（2篇）, American Journal of Human Genetics, JAMA Ophthalmology （3篇）, Cell Reports Medicine, BMC Medicine, European Journal of Epidemiology, International Journal of Epidemiology, Human Molecular Genetics等期刊。

先后受邀為幾十個(gè)國際期刊審稿，包括Nature Genetics, Cell Genomics, American Journal of Human Genetics, Cell Reports, Nature Communications, Ophthalmology, JAMA Ophthalmology, BMC Medicine, European Journal of Epidemiology等。

代表性研究包括：1）基于大腦組織單細(xì)胞多組學(xué)，探究神經(jīng)精神類疾病的功能基因組學(xué)基礎(chǔ)（Nature， under review, first author）；2）基于多組學(xué)、功能基因組學(xué)，鑒定潛在的青光眼基因藥物靶點(diǎn)(Nature Genetics 2023)；3）整合大型隊(duì)列遺傳學(xué)，鑒定青光眼易感位點(diǎn)，系統(tǒng)評(píng)價(jià)遺傳風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型及臨床應(yīng)用價(jià)值(Nature Genetics 2020)；4）采用深度學(xué)習(xí)、大規(guī)模影像學(xué)、基因組學(xué)，進(jìn)行跨種族遺傳學(xué)研究(American Journal of Human Genetics 2021)。

崗位1：博士后（計(jì)算方向/實(shí)驗(yàn)方向）

招聘人數(shù)：2-3名

崗位職責(zé)：

1）與導(dǎo)師合作，提出科學(xué)問題、開展課題研究；

2）計(jì)算方向主要課題：a) genetics and single cell genomics; b) AI in genomics and healthcare；

3）實(shí)驗(yàn)方向：開展分子遺傳學(xué)、功能基因組學(xué)等相關(guān)研究，采用細(xì)胞/動(dòng)物模型、單細(xì)胞多組學(xué)、空間組學(xué)、organoid、iPSC、MPRA、CRISPR等技術(shù)，探究疾病遺傳調(diào)控機(jī)制。

應(yīng)聘條件（滿足以下之一）：

1）已取得或即將取得博士學(xué)位，有志于從事科學(xué)研究，學(xué)習(xí)能力較強(qiáng)，良好的溝通能力和合作精神；

2）對(duì)統(tǒng)計(jì)基因組學(xué)、深度學(xué)習(xí)、計(jì)算生物學(xué)、功能基因組學(xué)，或腦科學(xué)、神經(jīng)精神類疾病、眼科學(xué)等方向的科研工作有興趣。

3）計(jì)算方向：具有計(jì)算機(jī)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、生物信息學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、遺傳學(xué)等計(jì)算背景。熟悉常用統(tǒng)計(jì)或深度學(xué)習(xí)方法（VAE/CNN/transformer/diffusion model等），熟悉至少一門編程語言（Python/R等)及Linux系統(tǒng)操作等。

4）實(shí)驗(yàn)方向：具有分子生物學(xué)、生物化學(xué)和生物醫(yī)學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn)學(xué)科背景（眼科學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)優(yōu)先）；熟悉以下之一：細(xì)胞/動(dòng)物模型、單細(xì)胞多組學(xué)、空間組學(xué)、organoid、iPSC、MPRA、CRISPR等。課題組將為實(shí)驗(yàn)背景的同學(xué)提供計(jì)算方向的科研培訓(xùn)。

崗位待遇：

博士后申請(qǐng)者薪酬福利請(qǐng)參考：https://postdocs.bjmu.edu.cn/index.htm

全力協(xié)助申報(bào)博士后相關(guān)項(xiàng)目; 根據(jù)研究興趣，全力協(xié)助實(shí)現(xiàn)職業(yè)發(fā)展規(guī)劃。

崗位2：科研助理

招聘人數(shù)：1人

崗位職責(zé)：

1）參與或獨(dú)立開展課題研究。

2）實(shí)驗(yàn)方向能開展分子遺傳學(xué)、功能基因組學(xué)、單細(xì)胞/空間轉(zhuǎn)錄組等相關(guān)研究。

應(yīng)聘條件（滿足以下之一）：

1）已取得或即將取得本科或碩士學(xué)位，有志于從事科學(xué)研究，學(xué)習(xí)能力較強(qiáng)，良好的溝通能力和合作精神；

2）計(jì)算方向：具有計(jì)算機(jī)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、生物信息學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、遺傳學(xué)等相關(guān)計(jì)算背景。熟悉常用的統(tǒng)計(jì)/深度學(xué)習(xí)方法，熟悉一門編程語言（Python/R等)及Linux系統(tǒng)操作等。

3）實(shí)驗(yàn)方向：具有分子生物學(xué)相關(guān)實(shí)驗(yàn)學(xué)科背景（眼科學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)優(yōu)先）。

崗位待遇：

根據(jù)北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部相關(guān)規(guī)定執(zhí)行，簽定勞務(wù)派遣合同，薪資面議，交五險(xiǎn)一金。

應(yīng)聘程序

請(qǐng)將應(yīng)聘材料發(fā)送至genetics.genomics.lab@gmail.com，郵件標(biāo)題請(qǐng)注明"應(yīng)聘-崗位(博士后)-姓名"或"應(yīng)聘-崗位(科研助理)-姓名"。

應(yīng)聘材料

個(gè)人簡歷（包括學(xué)習(xí)工作經(jīng)歷、主要研究工作內(nèi)容、論文論著清單、成績單、獲獎(jiǎng)情況、科研興趣及未來研究計(jì)劃）及其他有借鑒意義的材料。請(qǐng)將材料合并為一個(gè)PDF。

其他說明

1）本招聘長期有效。

2）郵件若一周內(nèi)未回復(fù)，請(qǐng)?jiān)俅翁嵝�。符合要求申�?qǐng)者將會(huì)盡快安排面試。

3）歡迎對(duì)課題組研究方向感興趣的本科生、碩士生、博士生、訪問學(xué)者合作交流。

部分發(fā)表論文列表

« †joint first author, *corresponding author »

● Han X†*, Gharahkhani P†, Hamel AR, Ong JS, …, Hewitt AW, Craig JE, Pasquale LR, Mackey DA, Wiggs JL, Khawaja AP, Segrè AV, MacGregor S. Large scale multi-trait genome-wide association analysis identifies hundreds of glaucoma risk loci. Nature Genetics. 2023; 55(7):1116-1125

● Craig JE†, Han X†*, Qassim A†, Hassall M, …, Wiggs JL, Hewitt AW, MacGregor S. Multitrait analysis of glaucoma identifies new loci and enables effective polygenic risk score prediction of disease susceptibility, progression. Nature Genetics. 2020; 52(2):160-166.

● Han X*, Steven K, Qassim A, Marshall HN, Bean C, Tremeer M, An J, Siggs OM, Gharahkhani P, Craig JE, Hewitt AW, Trzaskowski M, MacGregor S. Automated AI labelling of optic nerve head enables new insights into cross-ancestry glaucoma risk and genetic discovery in >280,000 images from UKB and CLSA. American Journal of Human Genetics. 2021; 108(7):1204-1216.

● Han X*, Lains I, Li J, Li J, Chen Y, Yu B, Qi Q, Boerwinkle E, Kaplan R, Thyagarajan B, Daviglus M, Joslin CE, …, Miller J, Hu F, Willett W, Lasky-Su J, Kraft P, Richards JB, MacGregor S, Husain D, Liang L. Integrating genetics and metabolomics from multi-ethnic and multi-fluid data reveals putative mechanisms for age-related macular degeneration. Cell Reports Medicine. 2023;4(7):101085.

● Han X*, Hewitt AW, MacGregor S. Predicting the future of genetic risk profiling of glaucoma: a narrative review. JAMA ophthalmology. 2021;139(2):224-231.

● Han X†, Souzeau E†, Ong JS, An J, Siggs OM, Burdon KP, …, Hewitt AW, Gharahkhani P, Craig JE, MacGregor S. Myocilin Gene Gln368Ter Variant Penetrance and Association With Glaucoma in Population-Based and Registry-Based Studies. JAMA Ophthalmology. 2019; 137(1):28-35.

● Han X*, Gharahkhani P, Mitchell P, Liew G, Hewitt AW, MacGregor S. Meta-analysis of genome-wide association studies identify novel genes for age-related macular degeneration. Journal of Human Genetics. 2020; 65(8):657-665.

● Han X*, Ong JS, Hewitt AW, Gharahkhani P, MacGregor S. The effects of eight serum lipid biomarkers on age-related macular degeneration risk: a Mendelian randomization study. International journal of epidemiology. 2021; 50(1):325-336.

● Han X*, Liang L*. metabolomicsR: a streamlined workflow to analyze metabolomic data in R. Bioinformatics Advances. 2022; 2(1):vbac067.

« co-author »

● Daniszewski M, Senabouth A, Liang LH, Han X, Lidgerwood GE, Hernández D, …, Mackey DA, Craig JE, MacGregor S, Powell JE, Pébay A, Hewitt AW. Retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open angle glaucoma. Cell Genomics 2022, 2, 100142.

● Senabouth A, Daniszewski M, Lidgerwood GE, Liang HH, Hernández D, Mirzaei M, Keenan SN, Zhang R, Han X, Neavin D, Rooney L,… , Mackey DA, Bylsma G, Verma N, MacGregor S, Watt MJ, Guymer RH, Powell JE, Hewitt AW, Pébay A. Transcriptomic and proteomic retinal pigment epithelium signatures of age-related macular degeneration. Nature Communications. 2022 26;13(1):4233.

● Gharahkhani P., Jorgenson E., Hysi P., Khawaja A.P., Pendergrass S., Han X, Ong J.S., Hewitt A. W., …, Mackey D.A., Kubo M., Aung T., Craig J. E., MacGregor S., Wiggs J. L.. Genome-wide meta-analysis identifies 127 open-angle glaucoma loci with consistent effect across ancestries. Nature Communications. 2021;12(1):1258.

● Ong JS, An J, Han X, Law MH, Nandakumar P, …, Gharahkhani P, Kendall BJ, MacGregor S. Multitrait genetic association analysis identifies 50 new risk loci for gastro-oesophageal reflux, seven new loci for Barrett’s oesophagus and provides insights into clinical heterogeneity in reflux diagnosis. Gut. 2021; gutjnl-2020-323906.

● MacGregor S, Ong JS, An J, Han X, Zhou T, Siggs OM, …, Mackey DA, Gharahkhani P, Craig JE, Hewitt AW. Genome-wide association study of intraocular pressure uncovers new pathways to glaucoma. Nature Genetics. 2018; 50(8):1067-1071.